Pseudomonas putida profaag P3 geen PP_2277 kodeerib HEPN-domääniga faagikaitsevalku

Abstract

Pseudomonas putida on suure potentsiaaliga ja laialdase kasutusega mikroorganism. Paremaks kasutuseks tööstuses ja keskkonnatehnoloogias on vaja teada, kuidas bakter oma peamise vastase ehk bakteriofaagi eest ennast kaitseb. Viimasel ajal on avastatud mitmeid uusi geene, mis kaitsevad P. putida’t bakteriofaagide eest, samas ei ole nende kaitsemehhanisme hästi kirjeldatud. Üheks selliseks geeniks on PP_2277, mida kodeerib P. putida genoomis olev profaag P3. Selle uurimistöö eesmärk oli eksperimentaalselt iseloomustada P. putida profaag P3 geeni PP_2277 poolt vahendatud faagiresistentsuse mehhanismi. Tulemused näitasid, et PP_2277 võib olla endoribonukleaas, mis oletatavasti põhjustab abortiivset infektsiooni, kaitstes seega bakteripopulatsiooni osade CEPEST kollektsiooni G18 perekonda kuuluvate faagide eest.