Pseudomonas putida profaag P2 faagivastases kaitses

Abstract

Pseudomonas putida on keskkonnabakter, kelle faagitolerantsust on vähe uuritud. P. putida genoomis on neli profaagi ning meie uurimisgrupis on näidatud, et need võivad tõsta P. putida faagitolerantsust. Meie laboris nähti, et profaag P2 kaitseb P. putida’t viienda ja kuuenda perekonna faagide eest. Sellest lähtuvalt oli käesoleva bakalaureusetöö eesmärk uurida, kui suur on profaag P2 kaitseefekt ning tuvastada geen(id), mis selle eest vastutab(vad) kasutades profaag P2 deletsioonanalüüsi. Tulemused näitasid, et agarsöötmel on profaagi P2 kaitse G5 perekonna faagide eest 10-kordne ja vedelsöötmes 10- kuni 100-kordne. G6 perekonna faagide vastu kaitseb P2 agarsöötmel 10-1000-kordselt ja vedelkultuuris vähemalt 100- kordselt. Lisaks selgus, et G6 perekonna faagide virulentsust inhibeerib vedelsöötmesse lisatud CaCl2. Faagitolerantsuse eest vastutab profaagi geen PP_3026