Meeproovide metagenoomne analüüs mesilasperede RNA-viiruste seireks: uudse meetodi väljatöötamine

Abstract

Meemesilased (Apis mellifera) on olulised tolmeldajad, kuid nende populatsioonid on üha enam ohustatud patogeenide, nagu Varroa destructor ja Nosema spp., tõttu. Käesolevas uuringus töötati välja RNA-sekveneerimisel põhinevad meetodid mesilaste RNA-viiruste tuvastamiseks otse meest – see on mittesurev alternatiiv traditsioonilistele PCR-põhistele diagnostikameetoditele. Mesi peegeldab mesilaspere ja selle keskkonna geneetilist materjali, võimaldades tuvastada nii teadaolevaid kui ka harvaesinevaid viiruseid. Uuring viidi läbi EIP-AGRI projekti raames ning tuvastati mitmeid mesilaste viiruseid, sealhulgas Deformed Wing Virus, Chronic Bee Paralysis Virus, Black Queen Cell Virus ja Lake Sinai Virus 2, millest osa jääb tavapärastes testides sageli märkamatuks. Väljatöötatud meetod pakub paljulubavat võimalust laiemaks, varasemaks ja mittesurevaks viirusseireks mesinduses.