Mikroobse DNA kasutamine sepsist põhjustavate patogeenide tuvastamiseks

Abstract

Nakkushaiguste laialdane levik maailmas muudab uute diagnostikameetodite väljatöötamise äärmiselt oluliseks. Patogeeni kiire tuvastamine patsiendi proovist võimaldab infektsiooni täpset diagnoosimist ja õigeaegse ravi alustamist. Traditsiooniliste meetoditena patogeensete mikroobide tuvastamisel kasutatakse hetkel enim mikroobide külvamise meetodeid ning molekulaardiagnostilisi meetodeid (PCR meetod). Samas on nende kasutamisel omad piirangud, meetodid on küllaltki aeganõudvad ja ei võimalda kõiki haigustekitajaid tuvastada. Käesoleva töö eesmärk on anda ülevaade praegu kasutusel olevatest vedelbiopsial põhinevatest diagnostikameetoditest sepsist põhjustavate mikroorganismide tuvastamiseks. Lisaks uurida, millisest verefraktsioonist on võimalik tuvastada bakteriaalset DNA-d ja testida, kas ja mis määral on võimalik inimese genoomsest DNA-st vabaneda bakteriaalse DNA rikastamiseks.