Putukate taksonoomiline klassifitseerimine erinevate andmebaaside abil

dc.contributor.authorRikberg, Marten
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkondet
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituutet
dc.date.accessioned2025-08-04T10:03:14Z
dc.date.available2025-08-04T10:03:14Z
dc.date.issued2025
dc.description.abstractPutukate kasutamine toiduainetööstuses on kasvamas, mistõttu on oluline arendada täpseid viise nende DNA tuvastamiseks toidust. Töö keskendus toidu metagenoomsele analüüsile – meetodile, mis võimaldab kindlaks teha toidus esinevad liigid DNA põhjal. Eesmärk oli simuleerida erineva Acheta domesticuse lugemite sisaldusega toidu andmeid ning võrrelda KRAKEN2 abiga kolme erinevat andmebaasi putukate tuvastamiseks: nt_2024 nukleotiidide andmebaasi, mt_2025 mitokondrite andmebaasi ja full_genome_2025 täisgenoomide andmebaasi.
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10062/112305
dc.language.isoet
dc.publisherTartu Ülikoolet
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Estoniaen
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/ee/
dc.subjectKRAKEN2
dc.subjectAcheta domesticus
dc.subjectmetagenoomne sekveneerimine
dc.subjectsöödavad putukad
dc.subject.otherbakalaureusetöödet
dc.titlePutukate taksonoomiline klassifitseerimine erinevate andmebaaside abil
dc.typeThesisen

Failid

Originaal pakett

Nüüd näidatakse 1 - 1 1
Laen...
Pisipilt
Nimi:
Marten Rikberg.pdf
Suurus:
864.66 KB
Formaat:
Adobe Portable Document Format