Putukate taksonoomiline klassifitseerimine erinevate andmebaaside abil
Laen...
Kuupäev
Autorid
Ajakirja pealkiri
Ajakirja ISSN
Köite pealkiri
Kirjastaja
Tartu Ülikool
Abstrakt
Putukate kasutamine toiduainetööstuses on kasvamas, mistõttu on oluline arendada täpseid viise nende DNA tuvastamiseks toidust. Töö keskendus toidu metagenoomsele analüüsile – meetodile, mis võimaldab kindlaks teha toidus esinevad liigid DNA põhjal. Eesmärk oli simuleerida erineva Acheta domesticuse lugemite sisaldusega toidu andmeid ning võrrelda KRAKEN2 abiga kolme erinevat andmebaasi putukate tuvastamiseks: nt_2024 nukleotiidide andmebaasi, mt_2025 mitokondrite andmebaasi ja full_genome_2025 täisgenoomide andmebaasi.
Kirjeldus
Märksõnad
KRAKEN2, Acheta domesticus, metagenoomne sekveneerimine, söödavad putukad