Toksiin-antitoksiin süsteemide mõju Pseudomonas putida kohasusele ja stressitaluvusele

Abstract

Kromosomaalsete toksiin-antitoksiin süsteemide tähtsus bakteri elutegevusele ei ole selge, kuigi mitmed uuringud viitavad, et nad on olulised stressivastuses. Lisaks on ka viiteid, et toksiin-antitoksiin süsteemid võivad töötada ühtse võrgustikuna. Sellest lähtuvalt oli käesoleva töö eesmärgiks välja selgitada, kas mitme TA-süsteemi puudumisel Pseudomonas putida genoomist võiks olla mõju bakteri kohasusele ja stressitaluvusele. Leiti, et 13 ennustatud TA-süsteemi eemaldamisel ei ole olulist efekti ei P. putida kohasusele ega ka stressitaluvusele. Kuid avastati, et süsteemi PP4100-4101 eemaldamisega kaasnevad polaarsed efektid globaalse transkriptsioonifaktori gacA ekspressioonile ning süsteemi PP3899-3900 funktsiooniks on profaag P1 stabiliseerimine P. putida genoomis.