MRI bakalaureusetööd – Bachelor's theses

Selle kollektsiooni püsiv URIhttps://hdl.handle.net/10062/30295

Sirvi

Nüüd näidatakse 1 - 4 4

23S rRNA domeeni 0 mutatsioonide mõju E. coli kasvule ja ribosoomide biogeneesile
(Tartu Ülikool, 2023) Vaht, Agnes; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Ribosoom on molekulaarne masin, mille ülesandeks on valgu biosüntees. Bakteriaalne ribosoom koosneb väiksest ja suurest alaühikust, mille ülesanneteks on vastavalt mRNA dekodeerimine ja peptiidsideme katalüüs. Käesolev uurimustöö keskendub bakteriaalse ribosoomi suure alaühiku koosseisus oleva 23S rRNA tsentraalsele regioonile (nimetatakse domeen 0) ning täpsemalt selle heeliksile 72. Töö eesmärgiks oli teada saada, kuidas mõjutavad domeeni 0 heeliks 72 nukleotiidid E. coli kasvu ja ribosoomi biogeneesi. Selleks sisestati bakterisse E. coli 23S rRNA H72 punktmutatsioone sisaldavaid vektorplasmiide ning jälgiti konstrueeritud tüve kasvu ning ribosomaalsete alaühikute jaotumist sahharoosigradiendis. Töö tulemustest selgub, et ühegi 23S rRNA variandi ekspresseerimine ei põhjusta muutusi bakterirakkude generatsiooniajas. G2027A ja C2025U mutatsioonid põhjustavad ribosoomi biogeneesi defekti, mis väljendub ribosomaalsete partiklite gradiendiprofiilides, viidates H72 järjestuse olulisusele ribosoomide korrektse biogeneesi toimumiseks.
23S rRNA domeeni 0 mutatsioonide mõju ribosoomide biogeneesile
(Tartu Ülikool, 2019) Kattel, Carolin; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Ribosoomi funktsiooniks rakus on valkude biosüntees ehk translatsioon. Escherichia coli ribosoom koosneb väikesest (30S) ja suurest (50S) subühikust. Suur subühik koosneb 23S rRNA-st, 5S rRNA-st ja r-valkudest. 23S rRNA südamikdomeeniks on domeen 0, mis ühendab omavahel kõiki ülejäänud 23S rRNA domeene (I-VI). Bakalaureusetöö eesmärgiks oli selgitada 23S rRNA domeeni 0 heeliksite 25a ja 72 rolli ribosoomide biogeneesis, kasutades suunatud mutageneesi. Domeeni 0 heeliksite 25a ja 72 deletsioone sisaldavate 23S rRNA variantide ekspressioon põhjustab suurenenud 50S subühikute hulga rakus. Domeeni 0 heeliksis 72 punktmutatsiooni sisaldava 23S rRNA variandi ekspressioon põhjustab bakterirakkude pikenenud generatsiooniaega. Käesoleva töö tulemused viitavad, et mutatsioonid domeenis 0 põhjustavad suuremal või vähemal määral ribosoomi 50S subühiku assambleerimise defekte.
23S rRNA modifikatsioonide osa ribosoomide struktuuri stabiliseerimisel
(Tartu Ülikool, 2025) Reintam, Andres; Liiv, Aivar, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Ribosoomid teostavad valgusünteesi ning nende rRNA modifikatsioonid on olulised ribosoomi korrektseks talitluseks ja struktuuriks. Käesolev töö keskendub 23S rRNA modifikatsioonide rollile 50S alaühiku struktuurses stabiliseerimises. Eesmärgiks oli luua in vitro testsüsteem, et hinnata 23S rRNA V domeeni modifikatsioonide mõju peptidüültransferaassele aktiivsusele. Selleks analüüsiti metsiktüüpi ja modifikatsioonideta E. coli tüvedest (kus modifitseerivate ensüümide geenid olid inaktiveeritud) eraldatud 50S alaühikute stabiilsust ning aktiivsust. Tulemused näitasid, et 23S rRNA modifikatsioonid on kriitilised 50S alaühiku termostabiilsuse ja funktsionaalsuse säilitamiseks. Modifikatsioonide puudumine muutis ribosoomid temperatuuritundlikumaks, viidates nende panusele ribosoomi struktuuri kaitsmisel.
Eschericia coli 23S rRNA domeeni V modifikatsioonide tähtsusest
(Tartu Ülikool, 2014-06-11) Truu, Triin; Liiv, Aivar, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut

Sirvi

Sirvi MRI bakalaureusetööd – Bachelor's theses Märksõna "23S rRNA" järgi