Show simple item record

dc.contributor.advisorAndreson, Reidar, juhendaja
dc.contributor.authorJõesaar, Andrea
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkondet
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituutet
dc.date.accessioned2020-06-18T09:00:14Z
dc.date.available2020-06-18T09:00:14Z
dc.date.issued2020
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10062/68041
dc.description.abstractTänapäeval on ligi 2% täiskasvanutest toiduallergiad ja ka ristsaastumisel toitu sattunud allergeen osutuda mõnele allergikule ohtlikuks. Allergeenide tuvastamiseks proovist saab kasutada teise põlvkonna sekveneerimisel põhinevaid ​k ​ -meere ehk ​k pikkuseid DNA lõike kasutavad meetodeid, mis pakuvad suurt tundlikkust ning täpsust. Tänu oma haploidsele pärandumisele, rohkusele keskkonnaproovis ja vähesele rekombinatsioonile on liikide eristamiseks tüüpiliselt kasutusel mitokondriaalne DNA. Käesoleva töö põhieesmärk oli töötada välja metoodika spetsiifiliste ​k ​ -meeride leidmiseks sihtmärgiks olevate loomaliikide mitokondritest. Loodud meetod, mis põhineb filtreerimisel kasutades programmi ​nblast ​ , leiab ühele sihtmärgile ​k ​ -meeride komplekti keskmiselt 34 minutiga. Leiti, et saadud ​k ​ -meeride komplektid annavad üldiselt tugeva signaali, kui neid testida sihtmärgi täisgenoomil toorlugemitelet
dc.publisherTartu Ülikoolet
dc.rightsopenAccesset
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectk-meeridet
dc.subjecttoiduallergiaet
dc.subjectNGSet
dc.subjectGenomeTester4et
dc.subject.otherbakalaureusetöödet
dc.titleSpetsiifiliste ​k ​ -meeride leidmine inimesel toiduallergiat põhjustavate loomaliikide määramisekset
dc.typeThesiset


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

openAccess
Except where otherwise noted, this item's license is described as openAccess