Monte Carlo tree search in designing of high sensitivity derivatization reagents for mass spectrometric analysis
Date
2021
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Massispektromeetrilist analüüsi kasutatakse laialdaselt erinevate keemiliste ühendite
tuvastamiseks ja kvantiseerimiseks. Kahjuks on mõnede ühendite tundlikkus
massispektromeetrias madal. Üheks võimaluseks tundlikkust parandada on uuritavaid
ühendeid derivatiseerida. Töö eesmärgiks on disainida uudse struktuuriga reagente, mis
oluliselt parandaksid aminohapete massispektromeetrilise analüüsi tundlikkust. Selleks
kasutati erineva laiuse ja sügavusega Monte Carlo puu otsingut koos in-silico ionisatsiooni
efektiivsuse ennustamisega. Kõige efektiivsemaks osutus laia puu otsingu kasutamine, kus
juba esimese nelja sammuga saadi kõrget tundlikkust andvaid reagente. Parimad saadud
reagendid on umbes 50 korda paremad kui praegusel hetkel praktiliselt kättesaadavad
reagendid.
Description
Keywords
Puu otsing, graafid, massispektromeetria, optimeerimine